Orta Karadeniz Bölgesinde bulunan culex pipiens kompleks türlerinin moleküler olarak belirlenmesi

Abstract

Yapılan bu tez çalışmasında Orta Karadeniz Bölgesi’nde yayılım gösteren Culex pipiens tür kompleksinin belirlenmesi amacıyla 2014-2016 yılları mayıs eylül ayları arasında 14 noktadan örneklem yapılmıştır. Culex pipiens tür kompleksinde morfolojik tür teşhisinin problemlerinden dolayı türlerin statülerinin moleküler olarak belirlenmesi amacıyla Ace-2 gen bölgesinin bir kısmı çoğaltılmıştır. Alanda yoğun olarak yayılan Culex pipiens varyetelerinin belirlenmesi amacıyla CQ11 bölgesi çoğaltılarak moleküler teşhisleri yapılmaya çalışılmıştır. Morfolojik olarak kompleks üyesi olarak tanımlanan örnekler moleküler çalışmalarda kullanılmıştır. PZR reaksiyonu sonucunda elde edilen amplikonlar dizileme işlemine tabi tutulmuştur. Dizi verileri kromotogramları incelendikten sonra Mega7 programı yardımıyla hizalanmış ve Genbanktan alınan örneklerde eklenerek filogenetik ağaçlar çizilmiştir. Elde edilen verilere göre alanda sadece Culex pipiens türü olduğu ve bunun iki varyetesinin dağılım gösterdiği (Culex pipiens pipiens ve Culex pipiens f molestus) belirlenmiştir. Ülkemizde varlığı bilinen ve son dönemde moleküler olarak doğrulana Culex pipiens quinquefascitus ve bu kompleksin ikiz türü olan Culex torrentium örneklerine çalışma alanında rastlanmamıştır. Çizilen UPGMA ağacı Samsun Horhor deresinde sadece Culex pipiens f molestus varyetesinin varlığı göstermiştir. Amasya, Bafra, Giresun, Çarşamba, Ordu Ünye bölgelerinde her iki varyeteninde var olduğu ve diğer bölgelerde ise sadece Cx. pipiens pipiens varyetesinin varlığı belirlenmiştir. Genbank örnekleri ile karşılaştırma sonucunda örneklerimizin KM922631.1 nolu Culex pipiens pipiens örneğiyle yüksek oranda uyuştuğu belirlenmiştir. Çizilen ağaçta Culex pipiens quinquefasciatus Genbank örneğiyle ile olan uzaklığının Culex pipiens pallens’ten daha az olduğu ve en uzak türün Culex torrentium olduğu belirlenmiştir. 2017, 35 sayfa Anahtar Kelimeler: Culex pipiens kompleks, Ace-2, CQ11, Orta Karadeniz Bölgesi

Yapılan bu tez çalışmasında Orta Karadeniz Bölgesi’nde yayılım gösteren Culex pipiens tür kompleksinin belirlenmesi amacıyla 2014-2016 yılları mayıs eylül ayları arasında 14 noktadan örneklem yapılmıştır. Culex pipiens tür kompleksinde morfolojik tür teşhisinin problemlerinden dolayı türlerin statülerinin moleküler olarak belirlenmesi amacıyla Ace-2 gen bölgesinin bir kısmı çoğaltılmıştır. Alanda yoğun olarak yayılan Culex pipiens varyetelerinin belirlenmesi amacıyla CQ11 bölgesi çoğaltılarak moleküler teşhisleri yapılmaya çalışılmıştır. Morfolojik olarak kompleks üyesi olarak tanımlanan örnekler moleküler çalışmalarda kullanılmıştır. PZR reaksiyonu sonucunda elde edilen amplikonlar dizileme işlemine tabi tutulmuştur. Dizi verileri kromotogramları incelendikten sonra Mega7 programı yardımıyla hizalanmış ve Genbanktan alınan örneklerde eklenerek filogenetik ağaçlar çizilmiştir. Elde edilen verilere göre alanda sadece Culex pipiens türü olduğu ve bunun iki varyetesinin dağılım gösterdiği (Culex pipiens pipiens ve Culex pipiens f molestus) belirlenmiştir. Ülkemizde varlığı bilinen ve son dönemde moleküler olarak doğrulana Culex pipiens quinquefascitus ve bu kompleksin ikiz türü olan Culex torrentium örneklerine çalışma alanında rastlanmamıştır. Çizilen UPGMA ağacı Samsun Horhor deresinde sadece Culex pipiens f molestus varyetesinin varlığı göstermiştir. Amasya, Bafra, Giresun, Çarşamba, Ordu Ünye bölgelerinde her iki varyeteninde var olduğu ve diğer bölgelerde ise sadece Cx. pipiens pipiens varyetesinin varlığı belirlenmiştir. Genbank örnekleri ile karşılaştırma sonucunda örneklerimizin KM922631.1 nolu Culex pipiens pipiens örneğiyle yüksek oranda uyuştuğu belirlenmiştir. Çizilen ağaçta Culex pipiens quinquefasciatus Genbank örneğiyle ile olan uzaklığının Culex pipiens pallens’ten daha az olduğu ve en uzak türün Culex torrentium olduğu belirlenmiştir. 2017, 35 sayfa Anahtar Kelimeler: Culex pipiens kompleks, Ace-2, CQ11, Orta Karadeniz Bölgesi