• Türkçe
    • English
  • Türkçe 
    • Türkçe
    • English
  • Giriş
Öğe Göster 
  •   RTEÜ
  • Araştırma Çıktıları | TR-Dizin | WoS | Scopus | PubMed
  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
  • Öğe Göster
  •   RTEÜ
  • Araştırma Çıktıları | TR-Dizin | WoS | Scopus | PubMed
  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
  • Öğe Göster
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Complete genome sequence analysis and genome organization of Dasychira pudibunda nucleopolyhedrovirus (DapuNPV-T1) from Turkey

Göster/Aç

Full Text / Tam Metin (1.296Mb)

Erişim

info:eu-repo/semantics/closedAccess

Tarih

2024

Yazar

Gencer, Dönüş
Bayramoğlu, Zeynep
Demir, İsmail

Üst veri

Tüm öğe kaydını göster

Künye

Gencer, D., Bayramoglu, Z., & Demir, I. (2023). Complete genome sequence analysis and genome organization of Dasychira pudibunda nucleopolyhedrovirus (DapuNPV-T1) from Turkey. Archives of microbiology, 206(1), 16. https://doi.org/10.1007/s00203-023-03741-3

Özet

The economically important pale tussock moth Dasychira pudibunda L. (Lepidoptera: Lymantriidae), known as a beech pest in Europe, primarily inflicts damage on beech leaves. In the present study, we aim to reveal the genome characteristics of Dasychira pudibunda nucleopolyhedrovirus (DapuNPV-T1), which was detected for the first time in Turkey and compare it with the reference genome and other baculovirus genomes. The DapuNPV-T1 genome was determined to be a circular, double-stranded DNA molecule with 136,920 bp and a nucleotide distribution of 54.4% G + C. Bioinformatics analysis showed that the DapuNPV-T1 genome contains 163 open reading frames with more than 150 nucleotides. Fifty-four ORFs of unknown function, 6 homologous regions (hrs), 1 AC-rich region, and 3 bro genes (bro-a, bro-b, and bro-c) were determined in the genome sequence. Comparative analysis with other baculovirus strains revealed distinctions in the DapuNPV-T1 genome based on ORF. The gene parity plot and phylogenetic analysis confirmed that DapuNPV-T1 belongs to the alphabaculovirus group Ib. In addition, the DapuNPV-T1 isolate was found to be close to the nucleopolyhedrovirus Poland isolate in Dasychira pudibunda and Orgyia pseudotsugata multiple nucleopolyhedrovirus. With this study, the first genome analysis of DapuNPV from Turkey became the second in the world to enter the literature. Comprehensive information on a wide range of isolates will provide a more detailed overview of baculoviruses and help overcome their shortcomings as biocontrol agents.

Kaynak

Archives of Microbiology

Cilt

206

Sayı

1

Bağlantı

https://doi.org/10.1007/s00203-023-03741-3
https://hdl.handle.net/11436/8705

Koleksiyonlar

  • Pazar Meslek Yüksekokulu Koleksiyonu [73]
  • PubMed İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [2443]
  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [5931]
  • WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [5260]



DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 




| Yönerge | Rehber | İletişim |

DSpace@RTEÜ

by OpenAIRE
Gelişmiş Arama

sherpa/romeo

Göz at

Tüm DSpaceBölümler & KoleksiyonlarTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına GöreBu KoleksiyonTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına Göre

Hesabım

GirişKayıt

İstatistikler

Google Analitik İstatistiklerini Görüntüle

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 


|| Rehber|| Yönerge || Kütüphane || Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi || OAI-PMH ||

Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Rize, Türkiye
İçerikte herhangi bir hata görürseniz, lütfen bildiriniz:

Creative Commons License
Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Institutional Repository is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 Unported License..

DSpace@RTEÜ:


DSpace 6.2

tarafından İdeal DSpace hizmetleri çerçevesinde özelleştirilerek kurulmuştur.