• Türkçe
    • English
  • Türkçe 
    • Türkçe
    • English
  • Giriş
Öğe Göster 
  •   RTEÜ
  • Araştırma Çıktıları | TR-Dizin | WoS | Scopus | PubMed
  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
  • Öğe Göster
  •   RTEÜ
  • Araştırma Çıktıları | TR-Dizin | WoS | Scopus | PubMed
  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
  • Öğe Göster
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Codon usage bias in the photolyase gene of amsacta moorei entomopoxvirus

Göster/Aç

Tam Metin / Full Text (1.177Mb)

Erişim

info:eu-repo/semantics/closedAccess

Tarih

2024

Yazar

Aktürk Dizman, Yeşim

Üst veri

Tüm öğe kaydını göster

Künye

Aktürk Dizman, Y. (2024). Codon Usage Bias in the Photolyase Gene of Amsacta moorei Entomopoxvirus. Biology Bulletin, 51(S1), S52—S65. https://doi.org/10.1134/s1062359024610164

Özet

Abstract: Amsacta moorei entomopoxvirus (AMEV) is a poxvirus exclusively infecting insects and has been considered as a potential biological control agent. AMEV includes a CPD photolyase (AMV025, AMEV photolyase gene) responsible for converting cyclobutane pyrimidine dimers (CPDs) back into monomers. The codon usage patterns and their influence on the evolution of the AMEV photolyase gene are still widely uninvestigated. Here, we conducted a thorough examination of the codon usage bias (CUB) within the photolyase gene of AMEV and contrasted it with that of the photolyase genes found in five other entomopoxvirus species. Both nucleotide content and relative synonymous codon usage (RSCU) analysis indicated a higher frequency of AT-ending codons in the photolyase gene of AMEV. The effective number of codons (ENC) analysis revealed a high CUB in AMEV photolyase gene. The ENC-GC3s plot, neutrality plot, parity rule 2, correspondence analysis, and correlation analysis collectively indicated that both natural selection and mutation pressure impact the codon usage patterns of the AMEV photolyase gene, with natural selection emerging as the dominant factor shaping these patterns. Our research represents the inaugural effort to assess the codon usage pattern of the photolyase gene in AMEV, aiming to enhance our comprehension of the evolutionary dynamics within an entomopoxvirus.

Kaynak

Biology Bulletin

Cilt

51

Sayı

1

Bağlantı

https://doi.org/10.1134/s1062359024610164
https://hdl.handle.net/11436/9866

Koleksiyonlar

  • FEF, Biyoloji Bölümü Koleksiyonu [588]
  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [5931]
  • WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [5260]



DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 




| Yönerge | Rehber | İletişim |

DSpace@RTEÜ

by OpenAIRE
Gelişmiş Arama

sherpa/romeo

Göz at

Tüm DSpaceBölümler & KoleksiyonlarTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına GöreBu KoleksiyonTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına Göre

Hesabım

GirişKayıt

İstatistikler

Google Analitik İstatistiklerini Görüntüle

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 


|| Rehber|| Yönerge || Kütüphane || Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi || OAI-PMH ||

Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Rize, Türkiye
İçerikte herhangi bir hata görürseniz, lütfen bildiriniz:

Creative Commons License
Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Institutional Repository is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 Unported License..

DSpace@RTEÜ:


DSpace 6.2

tarafından İdeal DSpace hizmetleri çerçevesinde özelleştirilerek kurulmuştur.