Akciğer kanserli hastalarda plazma dna metiltransferaz ve metil- CpG'ye bağlanan protein seviyelerinin değerlendirilmesi

Abstract

Amaç: Akciğer kanseri, akciğer doku hücrelerinin kontrolsüz çoğalmasıyla oluşan ölümcül bir hastalıktır. Çevresel faktörlerle birlikte genetik ve epigenetik değişikliklerin kanser gelişimine neden olduğu bilinmektedir. DNA metilasyonu en önemli epigenetik değişimlerden biri olup, DNA metiltransferaz (DNMT) enzimleri tarafından katalizlenir ve metile-CpG'ye bağlanan proteinler (MBD1, MBD2, MeCP2 vb) yardımıyla gerçekleşir. Çalışmamızda metilasyon ilişkili proteinlerin plazma seviyeleri ile akciğer kanseri riski arasındaki ilişkinin araştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Araştırmamızda DNMT1, DNMT2 (TRDMT1), DNMT3A, DNMT3B, MeCP2, MBD1 ve MBD2 seviyeleri, 90 akciğer kanseri hastası (küçük hücreli dışı: 78, küçük hücreli:12) ve 90 kontrol bireyden elde edilen plazma örneklerinde Sandwich-ELISA yöntemi ile ölçüldü. Sonuçlar uygun istatistiksel yöntemler ile değerlendirildi. Bulgular: Kontrol ve akciğer kanserli hastaların DNMT3a, MBD2 ve MeCP2 seviyeleri arasında fark bulunmamıştır (p>0.05). DNMT1, TRDMT1, DNMT3b ve MBD1 seviyeleri ise kontrol ile karşılaştırıldığında akciğer kanserli bireylerde anlamlı oranda yüksek bulunmuştur (p<0.05). Sonuç: Araştırmamız sonucunda yüksek DNMT1, TRDMT1, DNMT3b ve MBD1 plazma seviyeleri ile akciğer kanseri arasında önemli bir ilişkili bulunmuştur. Bulgularımız, hastalığın erken tanısına yönelik araştırmalara katkı sağlayabileceği gibi, metilasyon ilişkili proteinlerin moleküler tanı aracı olarak ta kullanılabileceğini desteklemektedir

Objective: Lung cancer is a fatal disease caused by uncontrolled growth of lung tissue cells. It has been known that environmental factors, genetic and epigenetic changes are lead to tumorigenesis. DNA methylation is one of the important epigenetic changes, catalyzed by DNA methyltransferases (DNMTs) and performed with methyl-CpG binding proteins (MBD1, MBD2, MeCP2 etc.). In this study we aimed to determine the association between plasma levels of methylation associated proteins and lung cancer risk. Methods: The plasma levels of DNMT1, DNMT2 (TRDMT1), DNMT3A, DNMT3B, MeCP2, MBD1 and MBD2 measured with Sandwich-ELISA method in 90 of lung cancer patients (non-small cell: 78, small cell: 12) and 90 of healthy controls. Statistical analysis was performed with appropriate statistical methods. Results: When comparing the DNMT3a, MBD2 and MeCP2 levels, no significant differences were found between lung cancer patients and controls (p>0.05). The plasma concentration of DNMT1, TRDMT1, DNMT3b and MBD1 were found to be significantly high in lung cancer patients (p<0.05). Conclusion: As a result of our research, we found a significant relation between increased plasma levels of DNMT1, TRDMT1, DNMT3b and MBD1 and lung cancer. It is considered that our findings may contribute to researches for the early diagnosis of lung cancer and support the using of methylation associated proteins as molecular markers.