• Türkçe
    • English
  • Türkçe 
    • Türkçe
    • English
  • Giriş
Öğe Göster 
  •   RTEÜ
  • Araştırma Çıktıları | TR-Dizin | WoS | Scopus | PubMed
  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
  • Öğe Göster
  •   RTEÜ
  • Araştırma Çıktıları | TR-Dizin | WoS | Scopus | PubMed
  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
  • Öğe Göster
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Investigation of a glioblastoma risk-associated SNP of the PTPRB Gene in familial glioblastoma

Thumbnail

Göster/Aç

Full Text / Tam Metin (3.104Mb)

Erişim

info:eu-repo/semantics/closedAccess

Tarih

2023

Yazar

Sevim Nalkıran, Hatice
Rakıcı, Sema Yılmaz
Nalkıran, İhsan

Üst veri

Tüm öğe kaydını göster

Künye

Nalkıran, H.S., Rakıcı, S.R. & Nalkıran, İ. (2023). Investigation of a Glioblastoma Risk-Associated SNP of the PTPRB Gene in Familial Glioblastoma. Journal of Oncological Science, 9(1), 15-22. http://doi.org/10.37047/jos.2022-93852

Özet

Objective: To investigate the association of the single nucleotide polymorphism (SNP) rs2252784 in the protein tyrosine phos-phatase receptor type B (PTPRB) gene with familial glioblastoma multiforme (GBM). Material and Methods: Genomic DNA was extracted from the peripheral blood samples of 2 sibling GBM patients, their 6 family members and 2 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tumor tissues. A 400 bp region was amplified and the restriction fragment length polymorphism (RFLP) technique was used to identify the rs2252784 SNP in exon 2 of the PTPRB gene. The GBM cell line T98G was used to validate the findings obtained from the tumor samples. Results: The analysis of DNA obtained from the blood samples of both GBM patients showed a wild-type (WT) genotype. However, the results of the PCR-RFLP analysis from FFPE tumor tissues showed that the first patient (proband) was heterozygous, and his sibling was homozygous for the rs2252784 variant. Discordant results between SNP analyses of the DNA samples isolated from the blood and FFPE tumor tissue were ob-served. The family members of the patients had either homozygous WT or heterozygous variants. Conclusion: The rs2252784 SNP was present in the tumor DNA of the patients but not in the DNA samples obtained from blood. This discrepancy might be the result of oncogenic DNA alterations associated with tumor formation. Paired analysis of tumors and blood samples from patients and patient-matched normal blood samples from GBM-affected families might provide additional insights into the underlying genetic alterations that occur during the development of a tumor in familial GBM.

Kaynak

Journal of Oncological Science

Cilt

9

Sayı

1

Bağlantı

http://doi.org/10.37047/jos.2022-93852
https://hdl.handle.net/11436/8396

Koleksiyonlar

  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [6000]
  • TF, Dahili Tıp Bilimleri Bölümü Koleksiyonu [1571]
  • TF, Temel Tıp Bilimleri Bölümü Koleksiyonu [699]
  • TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [2844]



DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 




| Yönerge | Rehber | İletişim |

DSpace@RTEÜ

by OpenAIRE
Gelişmiş Arama

sherpa/romeo

Göz at

Tüm DSpaceBölümler & KoleksiyonlarTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına GöreBu KoleksiyonTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına Göre

Hesabım

GirişKayıt

İstatistikler

Google Analitik İstatistiklerini Görüntüle

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 


|| Rehber|| Yönerge || Kütüphane || Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi || OAI-PMH ||

Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Rize, Türkiye
İçerikte herhangi bir hata görürseniz, lütfen bildiriniz:

Creative Commons License
Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Institutional Repository is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 Unported License..

DSpace@RTEÜ:


DSpace 6.2

tarafından İdeal DSpace hizmetleri çerçevesinde özelleştirilerek kurulmuştur.