• Türkçe
    • English
  • Türkçe 
    • Türkçe
    • English
  • Giriş
Öğe Göster 
  •   RTEÜ
  • Araştırma Çıktıları | TR-Dizin | WoS | Scopus | PubMed
  • WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
  • Öğe Göster
  •   RTEÜ
  • Araştırma Çıktıları | TR-Dizin | WoS | Scopus | PubMed
  • WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
  • Öğe Göster
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Identification of the potential matrix protein of invertebrate iridescent virus 6 (IIV6)

Thumbnail

Göster/Aç

Full Text / Tam Metin (4.614Mb)

Erişim

info:eu-repo/semantics/closedAccess

Tarih

2023

Yazar

Gencer, Dönüş
Yeşilyurt, Aydın
Özşahin, Emine
Muratoğlu, Hacer
Yazıcı, Zihni Açar
Demirbağ, Zihni
Nalcacıoğlu, Remziye

Üst veri

Tüm öğe kaydını göster

Künye

Gencer, D., Yesilyurt, A., Ozsahin, E., Muratoglu, H., Acar Yazici, Z., Demirbag, Z., & Nalcacioglu, R. (2023). Identification of the potential matrix protein of invertebrate iridescent virus 6 (IIV6). Journal of invertebrate pathology, 197, 107885. https://doi.org/10.1016/j.jip.2023.107885

Özet

Invertebrate iridescent virus 6 (IIV6) is a nucleocytoplasmic virus with a similar to 212 kb linear dsDNA genome that encodes 215 putative open reading frames (ORFs). Proteomic analysis has revealed that the IIV6 virion consists of 54 virally encoded proteins. Interactions among the structural proteins were investigated using the yeast two-hybrid system, revealing that the protein of 415R ORF interacts reciprocally with the potential envelope protein 118L and the major capsid protein 274L. This result suggests that 415R might be a matrix protein that plays a role as a bridge between the capsid and the envelope proteins. To elucidate the function of 415R protein, we determined the localization of 415R in IIV6 structure and analyzed the properties of 415R-silenced IIV6. Specific antibodies produced against 415R protein were used to determine the location of the 415R protein in the virion structure. Both western blot hybridization and immunogold electron microscopy analyses showed that the 415R protein was found in virions treated with Triton X-100, which degrades the viral envelope. The 415R gene was silenced by the RNA interference (RNAi) technique. We used gene-specific dsRNA's to target 415R and showed that this treatment resulted in a significant drop in virus titer. Silencing 415R with dsRNA also reduced the transcription levels of other viral genes. These results provide important data on the role and location of IIV6 415R protein in the virion structure. Additionally, these results may also shed light on the identification of the homologs of 415R among the vertebrate iridoviruses.

Kaynak

Journal of Invertebrate Pathology

Cilt

197

Bağlantı

https://doi.org/10.1016/j.jip.2023.107885
https://hdl.handle.net/11436/8229

Koleksiyonlar

  • PubMed İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [2443]
  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [6011]
  • TF, Temel Tıp Bilimleri Bölümü Koleksiyonu [699]
  • WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [5260]



DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 




| Yönerge | Rehber | İletişim |

DSpace@RTEÜ

by OpenAIRE
Gelişmiş Arama

sherpa/romeo

Göz at

Tüm DSpaceBölümler & KoleksiyonlarTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına GöreBu KoleksiyonTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına Göre

Hesabım

GirişKayıt

İstatistikler

Google Analitik İstatistiklerini Görüntüle

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 


|| Rehber|| Yönerge || Kütüphane || Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi || OAI-PMH ||

Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Rize, Türkiye
İçerikte herhangi bir hata görürseniz, lütfen bildiriniz:

Creative Commons License
Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Institutional Repository is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 Unported License..

DSpace@RTEÜ:


DSpace 6.2

tarafından İdeal DSpace hizmetleri çerçevesinde özelleştirilerek kurulmuştur.